苔藓生长基质是否会对苔藓的生长和元素含量造成影响是一个倍受争议的问题。一种观点认为，苔藓由干其特殊的形态和生理结构。即，没有真正的根和维管束组织，不从基质中吸收营养．因而认为苔藓的生长受基质的影响小。对于苔藓植物中所含元素的来源，普遍认为认为主要是来源于大气。许多研究表明，虽然少数元素会受到土壤扬尘的影响，苔藓中的大部分元素含量与大气污染程度其有明显的相关性。例如，冶炼厂和炼钢厂附近的污染排放使当地苔藓体内铬、铜和镍的含量增加。对苔藓植物体内重金属含带与其生长基质元素含量的相关性进行了分析，结果表明不存在相关性，证明苔藓植物从基质中吸收营养物质的可能性小。

然而，随着对苔藓植物与环境相互关系研究的深入，也有人开始怀疑大气并不是苔藓植物养分的唯一来源。认为土壤以及岩石表面风化物也是苔藓植物、特别是土生和石生苔藓的来源之一。目前对于苔藓植物受土壤影响的研究文献较少，但有迹象表明，生长土壤对苔藓植物体内的化学元素的组成和一含量有一定的贡献。在意大利部分地区的研究发现，在相对没有污染的地方采集的疣柄藓中，化学元素的含量受上壤影响很大。关于岩石对苔藓植物化学组成的影响，目前还没有定沦，但苔藓生长地的岩石必定与其发生关系。

采用不同基质对苔藓的培养结果也表明，以河沙为主、含有不同程度的有机质、通透性好的沙质土壤有利于苔藓植物对离子的转换和运输，从而利于其生长繁殖。对土生苔藓来说，上壤水分、土层厚度和松散度以及王壤粘性等对苔藓的生长和分布存在一定的影响。如立碗藓、黄色真藓等在土层肥厚的壤性七或枯质性土中分布较多。

对于树附生苔藓，树皮性质包括树皮硬度、持水性能、 pH 值及缓冲性能、树胶与单宁、盐分浓度、树干曲折度等均对苔藓生长有影响。其中，树皮含水量是影响附生苔藓盖度的一个主要因子。但在不受水分限制的湿润地区，树皮 pH 是影响苔藓生长的主要因素，酸度强的树皮不利于苔藓生长。